বর্তমান অপারেটরের লোকবল দিয়েই পরিচালিত হবে এনসিটি, তত্ত্বাবধানে থাকবে নৌবাহিনী
গত ১৭ বছর ধরে এনসিটিতে টার্মিনাল অপারেটর হিসেবে নিযুক্ত আছে দেশীয় প্রতিষ্ঠান সাইফ পাওয়ারটেক। তবে বারবার ডিপিএম পদ্ধতিতে প্রতিষ্ঠানটিকে অপারেটর নিয়োগ দেওয়ায় নানা বিতর্কেরও সৃষ্টি হয়েছে।